水利建设基金的计算方式是根据建设项目的规模和投资额来确定的。一般来说，水利建设基金的计算公式如下：水利建设基金=建设项目投资额×基金比例 其中，建设项目投资额是指水利建设项目的总投资额，基金比例是根据具体情况确定的。
四）按照国家政策规定减免流转税的，水利建设基金同时减免；（五）其他经省人民政府批准减免的项目。
自2022年起，一年内停产6个月以上或亏损达到注册资本30%及以上的企业（从事国家限制或淘汰行业的企业除外），可免缴当年地方水利建设基金。
一）对纳入市级财政预算管理的公（水）路运输管理费、征地管理费等政府性基金和城市维护建设税，由市级财政部门按月提取水利建设基金，划入市级财政水利建设基金专户。
法律分析：从事生产经营的单位和个人应缴纳的水利建设基金，由地方税务机关根据增值税和营业税的纳税期限按月或按季征收。
水利基金可计入营业外支出、营业税金及附加和管理费用。但水利基金一般应计入“税金及附加”科目核算。营业税金及附加是损益类科目。
水利建设基金计入税金及附加科目。水利建设基金是按规定向国家机关、社会团体、企事业单位和在职职工征收的，用于防洪保安、重点水利工程建设的资金。通常按企业当期营业收入进行征缴。
水利建设基金应计入“税金及附加”科目进行核算。水利建设基金是专项用于水利建设的政府性基金，由中央水利建设基金和地方水利建设基金组成。
计入税金及附加科目，具体如下：计提时：借：税金及附加，贷：应交税费—应交水利建设基金，缴纳时：借：应交税费—应交水利建设基金，贷：银行存款。
水利基金应计入 税金及附加科目核算。水利基金是指为了支持水利事业发展而由相关单位或个人按照一定比例缴纳的资金。水利基金的征收是为了保障水资源的合理利用和水利设施的建设与维护。